Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RARRES1P49788 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARRES1P49788 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms