Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRIM1P49642 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRIM1P49642 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms