Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPFP49454 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPFP49454 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPFP49454 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPFP49454 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPFP49454 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPFP49454 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPFP49454 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPFP49454 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPFP49454 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPFP49454 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms