Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTAP49354 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNTAP49354 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FNTAP49354 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FNTAP49354 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FNTAP49354 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FNTAP49354 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms