Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POU3F4P49335 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms