Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIP4K2AP48426 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms