Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATRXP46100 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATRXP46100 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATRXP46100 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATRXP46100 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms