Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR4A2P43354 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms