Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A4P43007 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms