Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL35P42766 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL35P42766 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL35P42766 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms