Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA2P42765 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms