Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3CBP42338 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms