Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJC1P36383 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJC1P36383 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJC1P36383 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJC1P36383 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJC1P36383 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJC1P36383 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GJC1P36383 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJC1P36383 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJC1P36383 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms