Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT2P35908 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT2P35908 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT2P35908 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT2P35908 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT2P35908 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT2P35908 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT2P35908 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT2P35908 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms