Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN2P35609 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms