Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFTPDP35247 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms