Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP6P35125 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP6P35125 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP6P35125 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP6P35125 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP6P35125 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP6P35125 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP6P35125 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP6P35125 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP6P35125 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP6P35125 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP6P35125 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP6P35125 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms