Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPS1P31327 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPS1P31327 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPS1P31327 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPS1P31327 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPS1P31327 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPS1P31327 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPS1P31327 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPS1P31327 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPS1P31327 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CPS1P31327 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPS1P31327 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPS1P31327 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPS1P31327 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPS1P31327 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CPS1P31327 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms