Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTR2AP28223 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTR2AP28223 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms