Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTX3P26022 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTX3P26022 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTX3P26022 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTX3P26022 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTX3P26022 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTX3P26022 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTX3P26022 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTX3P26022 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTX3P26022 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms