Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSSP25774 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSSP25774 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms