Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GADD45AP24522 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GADD45AP24522 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms