Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGS1P23219 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS1P23219 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS1P23219 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS1P23219 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS1P23219 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGS1P23219 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms