Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB5AP20339 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms