Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDSP20132 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDSP20132 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDSP20132 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDSP20132 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDSP20132 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDSP20132 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDSP20132 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDSP20132 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDSP20132 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms