Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A1P19634 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A1P19634 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms