Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM21P19474 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms