Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPI1P17947 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPI1P17947 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPI1P17947 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPI1P17947 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms