Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DESP17661 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DESP17661 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DESP17661 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DESP17661 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DESP17661 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DESP17661 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DESP17661 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms