Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms