Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRG2P13727 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRG2P13727 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms