Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCG2P13521 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCG2P13521 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms