Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP4P12644 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP4P12644 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP4P12644 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP4P12644 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP4P12644 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BMP4P12644 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMP4P12644 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMP4P12644 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms