Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL11A1P12107 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL11A1P12107 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms