Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAMC1P11047 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms