Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VSIG8P0DPA2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VSIG8P0DPA2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms