Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
U2AF1L5P0DN76 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2AF1L5P0DN76 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms