Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB1P08034 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB1P08034 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB1P08034 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB1P08034 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB1P08034 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB1P08034 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB1P08034 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB1P08034 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms