Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THY1P04216 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THY1P04216 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THY1P04216 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THY1P04216 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THY1P04216 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
THY1P04216 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
THY1P04216 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
THY1P04216 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
THY1P04216 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms