Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGAP02671 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGAP02671 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGAP02671 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGAP02671 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGAP02671 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms