Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA2P02652 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA2P02652 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA2P02652 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA2P02652 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA2P02652 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOA2P02652 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOA2P02652 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOA2P02652 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOA2P02652 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms