Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA3O96018 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA3O96018 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
APBA3O96018 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBA3O96018 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBA3O96018 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBA3O96018 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms