Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD3O95983 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD3O95983 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD3O95983 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD3O95983 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD3O95983 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms