Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms