Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD4O95243 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD4O95243 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD4O95243 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD4O95243 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD4O95243 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD4O95243 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD4O95243 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD4O95243 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD4O95243 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD4O95243 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD4O95243 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms