Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA3O75145 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms