Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SELENOFO60613 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SELENOFO60613 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms