Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNT1O60563 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms