Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CXCL13O43927 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms