Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYNGR3O43761 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms